Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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