Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms