Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RTN1Q16799 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTN1Q16799 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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