Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EXT1Q16394 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms