Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC6Q16204 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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