Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNA6Q15825 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNA6Q15825 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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