Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF11Q15544 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms