Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDSNQ15517 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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