Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RABEP1Q15276 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms