Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDCD1Q15116 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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