Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRCAPQ14761 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms