Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms