Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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