Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM25Q14258 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM25Q14258 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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