Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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EXOSC2Q13868 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EXOSC2Q13868 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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