Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOFQ13790 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOFQ13790 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOFQ13790 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOFQ13790 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOFQ13790 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOFQ13790 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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