Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBA3CQ13748 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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TUBA3CQ13748 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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