Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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DNASE1L3Q13609 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNASE1L3Q13609 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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