Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NAE1Q13564 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NAE1Q13564 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms