Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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MKRN4PQ13434 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKRN4PQ13434 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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