Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XRCC4Q13426 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XRCC4Q13426 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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