Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLF1Q13351 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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