Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2BQ13224 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2BQ13224 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
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