Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF3Q13114 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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