Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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