Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM32Q13049 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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TRIM32Q13049 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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TRIM32Q13049 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM32Q13049 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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