Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RAB40BQ12829 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB40BQ12829 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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