Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMARCB1Q12824 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMARCB1Q12824 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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