Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFEMP1Q12805 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFEMP1Q12805 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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