Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBBP4Q09028 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms