Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms