Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPOCK1Q08629 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms