Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCN1BQ07699 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms