Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TFF3Q07654 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms