Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms