Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPCQ03188 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms