Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AP003692.1-201ENST00000521706 796 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC007922.2-201ENST00000579049 281 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC027013.1-201ENST00000554412 1057 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB1Q02641 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms