Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX1P83916 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX1P83916 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX1P83916 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms