Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIM1P81133 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SIM1P81133 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIM1P81133 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms