Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTA2P62736 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms