Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPD2P62316 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms