Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABCE1P61221 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms