Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1P60507 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms