Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CABP4P57796 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CABP4P57796 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CABP4P57796 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CABP4P57796 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CABP4P57796 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP4P57796 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms