Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN15P56746 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLDN15P56746 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLDN15P56746 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLDN15P56746 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN15P56746 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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