Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OXCT1P55809 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms