Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HADHBP55084 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HADHBP55084 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HADHBP55084 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms