Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LUMP51884 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LUMP51884 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LUMP51884 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LUMP51884 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LUMP51884 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LUMP51884 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms