Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDE6CP51160 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6CP51160 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms