Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPAP49450 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPAP49450 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPAP49450 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms